Ο Δημήτρης Κούντουρας ειδικεύεται σε ιστορικά είδη φλάουτου και στη μουσική από τον μεσαίωνα μέχρι το μπαρόκ. Άρχισε τις σπουδές του στο φλάουτο με ράμφος και στο φλάουτο στη Θεσσαλονίκη με τους G. Gourdier και I. Macovei. Σπούδασε φλάουτο με ράμφος, μπαρόκ φλάουτο και ιστορική ερμηνεία στην Ανώτατη Σχολή Μουσικής της Ουτρέχτης (μεταπτυχιακό δίπλωμα σολίστ 2001) με τους H. ter Schegget και W. Hazelzet και με υποτροφία του ιδρύματος Marco Fodella με τους D. Bragetti και Μ. Gatti στην Ακαδημία Μουσικής του Μιλάνου. Συνέχισε τις σπουδές του στα ιστορικά είδη φλάουτου στο Ανώτατο Ωδείο της Βιέννης και στη μουσική του μεσαίωνα στην Ανώτατη Σχολή Μουσικής του Τρόσινγκεν με τον K.Boeke (Master of Early Music). Είναι διδάκτορας μουσικολογίας του ΕΚΠΑ ενώ υπήρξε μεταδιδακτορικός υπότροφος του ΚΕΑΕ για την έρευνά του Η μουσική των τροβαδούρων στο λατινικό Βασίλειο της Θεσσαλονίκης, 1204 (εκδ. Νεφέλη/Fairead 2016). Ίδρυσε και διευθύνει το σύνολο παλαιάς μουσικής Ex Silentio ενώ έχει συνεργαστεί με τη Harmony of Nations Baroque Orchestra, με την Armonia Atenea και με τη Συμφωνική Ορχήστρα της Βιέννης. Διδάσκει στο Ωδείο Αθηνών, στο Πανεπιστήμιο Μακεδονίας και είναι επισκέπτης καθηγητής στην Ανώτατη Σχολή Μουσικής της Γενεύης. Είναι μέλος της καλλιτεχνικής επιτροπής του ευρωπαϊκού προγράμματος Emerging Plus Early Music στο Αμπρονέ της Γαλλίας.